Дія відбувається через 6 років після подій, описаних у «Хаос.Розум». Район вже відновлено, проте землетрус залишив великий психологічний відбиток на тих, хто вижив. Серед них і Такуру Міяшіро, який втратив у ньому батьків.
Повсякденне життя Такуру перериває серія з двох убивств за загадкових обставин, за розслідування яких він негайно береться, будучи членом клуба журналістики.