À Yokohama, rien n'est plus comme avant ; suite à une catastrophe, la ville a été engloutie par les eaux. C'est sur ses hauteurs que vit Alpha, un androïde à l'allure parfaitement humaine, chargée par son maître M. Hatsuseno de garder son café. Alors qu'elle attend son retour de pied ferme, elle reçoit un jour un colis de sa part, l'invitant à découvrir le monde qui l'entoure par elle-même...